A la mort de son grand-père, Jacob découvre les indices et l'existence d'un monde mystèrieux qui le mène dans un lieu magique : la maison de Miss Peregrine pour Enfants Particuliers. Mais le mystère et le danger s'amplifient quand il apprend à connaître les résident, leurs étranges pouvoirs.... et leurs puissants ennemis. Finalemen, Jacob découvre que seule sa propre "particularité" peut sauver ses nouveaux amis.